整骨院でも交通事故治療は行えます。
病院、医院と同じように自賠責保険(交通事故の保険)が使えます。治療途中であっても病院や医院からの転院も可能です。

基本的に、患者様が医療機関を選ぶ権利があります。
あくまでも、患者様ご自身が通いたい医療機関に通うのが普通であり、交通事故治療も同じです。